低聚半乳糖和低聚果糖可被双歧杆菌在肠道内选择性利用，但不同之处在于化学成分不同，生物功能和制备工艺也不同，日常应用也有很大差异。
1。化学成分不同：低聚果糖通常是果糖的一种，在酸性条件下加热更稳定，更容易分解，但半乳糖的首句通常由半乳糖和葡萄糖组成。杂低聚糖对酸和热稳定；
2。生物功能不同：低聚果糖通常是水溶性膳食纤维，一般被双歧杆菌、乳酸杆菌等有益菌选择利用，是高效的双歧杆菌增殖因子，而低聚半乳糖通常是肠道双歧杆菌促进因子，可以促进矿物质的吸收钙镁等，低聚半乳糖还可以促进人体消化吸收，改善乳糖不耐受；
3。制备工艺不同：低聚果糖一般采用天然原料提取和酶促合成的方法生产，低聚半乳糖也可采用化学合成的方法生产；
4。不同的生活应用：低聚果糖主要用于食品和保健品，如减肥美容和泻药等。由于低聚半乳糖具有良好的耐热性，可用于糖果和果酱中的糕点等产品。
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