自转基因食品问世以来，关于转基因食品的争论就没有停止过。目前，转基因食品还处于起步阶段，一些动物实验还没有做好。到目前为止，没有人敢说。食用转基因食品可以保证对人体无害。所以建议大家还是不要吃，多吃一些生态绿色的食物，以免对身体造成伤害。
生物浓度尚不清楚
食物链中有益物质的富集或有害物质的积累，对上层生物的健康极为关键。目前，大部分转基因作物用于饲料。这些转基因生物添加了它们以前没有的抗病虫害基因或抗杂草基因。它们体内的富集会发生什么变化，被牲畜富集后会发生什么？人类消费会产生什么，目前还缺乏全面系统的科学研究结论。
药食关系不明
利用转基因技术可以建立动物药库和植物药库，比如吃一个西红柿可以预防乙肝。但是，这种转基因药物是否对人体有风险，还需要长期的研究和监测才能明确。
生态影响尚不清楚
转基因生物具有自然生物所没有的优势。如果将它们释放到环境中，就会打破原有的生态平衡，改变物种之间的竞争。
基因污染
转基因生物引起的遗传漂移会破坏野生动物的遗传多样性。例如，转基因作物的花粉随风散落，由此产生的基因污染将难以预防。
目前，我国转基因食品越来越多，而且还存在乱养殖的大问题，对食品安全危害很大。因此，我国食品安全机构应承担起避免转基因食品问题的责任。此外，食品的标签要更加规范，让人们有选择吃的权利，也有选择不吃的权利。
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